木曜日, 8月 28, 2008

SSRをHRMで

New PhytologistをブラウズしていたらEarly ViewにHRMの論文があったので読んでみました。

Croxford A.E., Rogers T., Caligari P.D. and Wilkinson M.J., 2008.
High-resolution melt analysis to identify and map sequence-tagged site
anchor points onto linkage maps: a white lupin (Lupinus albus) map as an
exemplar. New Phytol.

 この論文はHRMでマップを初めて構築したというのが売りのようなのですが、論文を読んでこういう手もあるなと思ったのは、SSRもHRMでタイピングしてしまうというものです。SSRで断片長多型がなくてもSNPが拾えるかもしれません。なのでマーカー数を稼ぎたい場合はSSRで断片長多型がないからといって諦めずにHRMを試してみるのも手だと思います。

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